新北市政府衛生局隸屬於新北市政府，現有編制中，局長綜理局務外，置副局長2人，主任秘書1人，下設健康管理、疾病管制、醫事管理、食品藥物管理、衛生企劃、心理衛生、檢驗、衛生稽查等8科及秘書、會計、人事、政風等4室。局內正式編制238人，29區衛生所編制497人，市立聯合醫院編制378人，高齡長期照顧處68人，全局及各院所編制共1,181人。